Корпус MSI MAG PANO M100R PZ относится к серии MAG и ориентирован на компактные, но мощные сборки. Mini-Tower имеет стальной каркас, переднюю панель и левую боковину из закаленного стекла, а вентиляционные участки закрыты металлической сеткой. Модель полностью выполнена в черном цвете. Блок питания формата ATX не входит в комплект и устанавливается в нижней части корпуса. Габариты 235x405x440 мм, вес 8,66 кг.
Внутреннее пространство рассчитано на материнские платы micro-ATX и пять слотов расширения. Видеокарта помещается длиной до 390 мм, процессорный кулер — высотой до 175 мм, блок питания — до 200 мм. Для накопителей есть один отсек 2,5" и один 3,5". HDD размещается поперечно, без отдельной корзины. Верхний и нижний пылевые фильтры защищают компоненты от пыли.
Охлаждение — одна из сильных сторон модели. С завода установлено четыре вентилятора: три на боковой панели (120 мм) и один на задней (120 мм). Если этого недостаточно, можно добавить до трёх 120-мм или до четырёх 140-мм вентиляторов. Также есть крепления для СВО с радиаторами 120, 140, 240 и 360 мм. AirDuct на боковой стенке направляет холодный воздух прямо на процессор, улучшая общий теплосъем.
Передняя панель оснащена одним разъемом USB 3.1 Type-C, одним USB 3.0, аудиоразъемами и кард-ридером. Благодаря закаленному стеклу все компоненты и подсветка отлично просматриваются. Корпус удобен в сборке: нижнее расположение БП, продуманная компоновка каналов для кабелей и съемные фильтры делают эксплуатацию простой.